Если в договоре транспортной экспедиции указано, что экспедитор должен хранить товары, загружать и разгружать машины на складе грузоотправителя, то можно применять нулевую ставку НДС. Такое мнение изложено в письме ФНС РФ № СД-4-3/10498@ от 14.06.2016 г.
Поскольку понятие видов услуг, относящихся к вышеуказанным транспортно-экспедиционным услугам, нормой подпункта 2.1 пункта 1 статьи 164 Налогового кодекса не определено, следует руководствоваться ГОСТ Р 52298-2004 «Услуги транспортно-экспедиторские», утвержденным приказом Ростехрегулирования от 30.12.2004 N 148-ст., в пункте 3.1 которого и перечислены конкретные виды услуг.
Если же услуги, предусмотренные абзацем пятым подпункта 2.1 пункта 1 статьи 164 Налогового кодекса, оказываются не на основании договора транспортной экспедиции и (или) не при организации международной перевозки, то реализация таких услуг подлежит налогообложению на основании пункта 3 статьи 164 Налогового кодекса по ставке 18 процентов.